椎管内麻醉作为有创操作，需对背部皮肤进行穿刺，通过穿刺针或导管将局部麻醉药注入蛛网膜下腔或硬膜外腔。在脊髓表面的如上操作有着极大的细菌感染的风险，故背部疖肿或皮肤感染为椎管内麻醉的禁忌证。凝血功能障碍的患者采用椎管内麻醉可能会导致硬膜外腔的血肿，从而导致截瘫等恶劣并发症。宫外孕、失血过多、存在休克表现、严重高血压、呼吸功能不全的患者亦不适合椎管内麻醉。