脊髓脊膜膨出症多数应通过手术进行治疗，脊膜膨出伴有脊髓和神经膨出时，其手术比单纯脊膜膨出相对复杂，单纯脊膜膨出只需将脊膜囊进行软组织修复、还纳。​而伴有脊髓和神经膨出的患者，需将膨出的脊膜囊内神经和脊髓组织进行仔细的梳理、游离，从而还纳入椎管内，使脊髓和神经呈现正常的走向，有可能使患者脊髓功能与正常人的脊髓功能相接近。建议脊髓脊膜膨出症患者早期进行手术，晚期脊髓脊膜膨出由于膨出时间比较长，可能与其它组织造成粘连，在游离过程中会出现损伤，功能恢复可能不太理想。早期进行手术手术治疗，可使脊髓膨出患者的恢复达到较理想程度。